Boshqa dori vositalari bilan kombinatsiyalanganida, shunga o‘xshash toksiklikka ega bo‘lgan dori vositalari bilan qo‘llanganda nojo‘ya ta'sirlar rivojlanish xavfi ortadi. Periferik neyropatiya preparatni qo‘llashda og‘ir va dozaga bog‘liq nojo‘ya ta'sir hisoblanadi. Bu ta'sir rivojlanish xavfi didanosin bilan bir vaqtda qo‘llanganda oshadi. Periferik neyropatiya odatda ikki tomonlama simmetrik qo‘l-oyoq uyushish hissi bilan kuzatiladi: oyoq kaftlarida ko‘proq, qo‘l kaftlarida kamroq sanjish va og‘riqlar. Klinik tadqiqotlarda bu reaksiyalar tez-tezligi dozaga va/yoki kasallik bosqichiga bog‘liq edi. Kasallikning dastlabki bosqichlarida bu hodisalar kamroq uchraydi.
Turli darajadagi pankreatit, jumladan, o‘lim bilan yakunlanishi mumkin, davolashning turli bosqichlarida rivojlanishi mumkin va preparat monoterapiya shaklida yoki boshqa preparatlar bilan kombinatsiyalangan holda qo‘llanilishi yoki immunosupressiya darajasidan qat'i nazar sodir bo‘lishi mumkin. Preparat didanosin yoki oshqozon osti beziga toksik ta'sir ko‘rsatadigan boshqa preparatlar bilan birga qo‘llanganda pankreatit rivojlanish xavfi oshadi.
Sut kislotasi asidozi. Gepatomegaliya bilan og‘ir steatoz shakli, shu jumladan o‘lim bilan yakunlanishi mumkin bo‘lgan hollarda, nukleozid analoglari monoterapiya yoki boshqa antiviral preparatlar, jumladan, stavudin bilan birga qo‘llanganda kuzatiladi. Stavudin didanosin bilan birga qo‘llanganda jigar funktsiyasining buzilishi xavfi sezilarli darajada oshadi. Ko‘ngil aynishi, qusish, qorin sohasidagi og‘riqlar, tez-tez nafas olish yoki nafas qisishi, mushaklarning kuchsizligi sut kislotasi asidozi rivojlanishini ko‘rsatishi mumkin.
Boshqa nojo‘ya ta'sirlar: trombotsitopeniya, gepatit, jigar funktsiyasining buzilishi, asteniyada, bosh og‘rig‘i, uyqusizlik, bosh aylanishi; og‘izning qurishi, ishtahaning pasayishi, diareya, pankreatit; jigar transaminazlari faolligining oshishi, gipyerbilirubinemiya, neyropeniya, allergik reaksiyalar (teri toshmasi, isitma), artralgiya, miyalgiya, sovuq qotishi.
Klinik tadqiqotlarda bolalar va kattalarda preparatning nojo‘ya ta'sirlari o‘xshash edi. Bolalarda periferik neyropatiya rivojlanishi kattalarga qaraganda kamroq kuzatildi. Biroq, bolalarda periferik neyropatiya simptomlarini aniqlash qiyinroq edi.