Farmakokinetik ma'lumotlar gemtsitabin infuziya orqali 0,4-1,2 soat davomida 500 dan 2592 mg/m² gacha bo‘lgan dozalarda qo‘llanganda baholandi. Cmax plazmada infuziya tugagandan 5 daqiqa o‘tib 3,2 dan 45,5 mkg/ml gacha bo‘ladi. 1 g/m² dozada 30 daqiqalik bir martalik infuziyadan keyin plazmadagi modda kontsentratsiyasi infuziya tugaganidan keyin taxminan 30 daqiqa davomida 5 mkg/ml dan yuqori bo‘ladi va so‘ngra yana bir soat davomida 0,4 mkg/ml dan yuqori darajada saqlanadi. Plazma oqsillari bilan bog‘lanishi past (10% dan kam). Markaziy kamera uchun Vd ayollarda 12,4 l/m², erkaklarda esa 17,5 l/m² ni tashkil qiladi (individual farqlanish 91,9%). Periferik kamera uchun Vd 47,4 l/m², va jinsga bog‘liq emas.
Metabolizm va chiqarilish Gemtsitabin jigarda, buyrakda, qonda va boshqa to‘qimalarda sitidindezaminaza fermenti tomonidan metabolizmga uchraydi. Ichki hujayra metabolizmida gemtsitabin mono-, di- va trifosfat hosilalariga aylanadi, shundan di- va trifosfatlar faol metabolit hisoblanadi. Bu hujayra ichidagi metabolitlar plazma va siydikda aniqlanmaydi. Asosiy nofaol metabolit 2'-dezoksi-2',2'-diflorouridin plazmada va siydikda aniqlanadi. Infuziyadan bir hafta o‘tib, gemtsitabin miqdorining 92-98% metabolizmga uchraydi. T1/2 jins va yoshga bog‘liq holda 42 dan 94 daqiqagacha davom etadi. Gemtsitabin tavsiya etilgan dozada yuborilganda, preparat infuziya boshlanganidan keyin 5-11 soat davomida chiqariladi. Sistemik klirens 29,2 l/soat/m² dan 92,2 l/soat/m² gacha bo‘lib, yosh va jinsga bog‘liq (individual farqlanish 52,2%). Ayollarda klirens erkaklarnikidan taxminan 25% past. Yosh ortgani sayin klirens darajasi erkak va ayollarda kamayadi. Gemtsitabin infuziyasi 1 g/m² dozada 30 daqiqa davomida yuborilganda, klirensning pasayishi bilan dozani kamaytirish talab etilmaydi.
Buyrak klirensi 2-7 l/soat/m² bo‘lib, asosiy chiqarilish buyrak orqali (99%) amalga oshadi va kamroq qismi (1% dan kam) ichak orqali chiqariladi. Buyraklar orqali o‘zgarmagan holda 10% dan kam qismi chiqariladi. Haftada bir marta qo‘llanganda gemtsitabin organizmda to‘planmaydi.
Maxsus klinik holatlar Paklitaksel bilan birgalikda qo‘llanganda farmakokinetika o‘zgarishsiz qoladi. Karboplatin bilan birgalikda qo‘llanganda ham gemtsitabin farmakokinetikasiga ta’sir qilmaydi.
Buyrak yetishmovchiligi yengil va o‘rtacha darajada (glomerulyar filtratsiya darajasi 30-80 ml/min bo‘lganda) gemtsitabin farmakokinetikasiga sezilarli ta’sir ko‘rsatmaydi.